发布时间:2023-10-13 12:45:13 | 来源:东方头条 作者: 责任编辑:
高通量测序揭示中国西南地区肺腺癌患者组织中微生物群落特征
2023年2月,昆明医科大学附属第一医院胸外科陈小波团队在 Environmental science and pollution research international (IF=5.19)杂志发表了一篇研究型文章。研究使用16S rRNA技术检测40例昆明地区肺腺癌患者肺部菌群, 发现双歧杆菌属可能在淋巴结转移和肿瘤进展中发挥重要作用,为肺腺癌诊断提供潜在的生物标志物。
导读
人们通常认为肺部为无菌状态,但最新证据表明,肺部存在一种独特的微生物群,并与肺部肿瘤恶性转化有关。肺部微生物群落与肺癌之间的相互作用尚不明确。目前,肺部微生物研究多集中于痰液或肺泡灌洗液,少有研究集中于肺组织,本研究将肺癌组织作为检测样本,以探究微生物组成与肺癌临床特征之间的相关性。
/ 研究亮点 /
1、检测样本为肺癌组织, 较唾液、深痰和肺 泡灌洗液样本 更能反映肺部微生物的真实 情况;
2、分析肿瘤分期、淋巴结转移情况、吸烟状况与肺腺癌患者肺部菌群相关性,发现了特征差异微生物双歧杆菌;
3、首次报道了关于中国西南城市——昆明肺腺癌患者的肺部微生物特征。
/ 研究结果 /
1、肺癌组织样本中鉴定出951个OTUs
在门水平,厚壁菌门(32.4%±12.1%)、变形菌门(24.5%±25.1%)、放线菌门(17.3%±11.3%)、拟杆菌门(16.7%±14.0%)和疣微菌门(3.3%±4.2%)检出占主要优势(平均相对丰度 >1% )。在属水平,共鉴定出21个属(平均相对丰度 >1% ),其中双歧杆菌属、莫拉氏菌属的相对丰度最高(图 1)。
图1 所有样品中优势菌属的相对丰度分布
2、肺腺癌各分组微生物多样性相似
香农指数是一种衡量群落中物种多样性的参数,结果显示各分组物种多样性没有显著性差异(图 2)。
(分组:N0期与N+期、T1期与T2期、临床分期(I、II、III期)、吸烟与不吸烟)
图2 肺腺癌各分组间的香农指数分析
3、不同分组的微生物群落组成显著性差异
N0组和N+组之间菌群分析明显分离( p <0.001)( 图 3A ),且差异显著 (图 3B );T1组中的大多数样本相对于T2组更加均匀和聚集(图 3C ), 且差异显著 ( p <0.001) ( 图 3D );同样地,在临床 I、II和III期分组中,各分期菌群明显分离(图 3E),且任意两组分期中菌群分布存在显著性差异(图 3F)。吸烟者和非吸烟者菌群分布没有显著性差异。
图3 肺腺癌各分组群组成比较
4、肺腺癌各分组差异物种分析
通过LEFSe分析,在N0和N+组中发现8个差异类群,包括2个纲、2个目、3个科、1个属,这些类群均在N+组中有更高的丰度(图 4A)。差异属为双歧杆菌属,其相对丰度水平在两组间差异显著 ( p <0.0 5 )(图 4B )。
图4 N0 和 N+组的差异物种分析
在T1组和T2组中共发现15个差异类群,包括5个门和10个属。门水平包括拟杆菌门、放线菌门、疣微菌门、变形菌门和梭杆菌门 (图 5A);属水平上,T2组中差异属为莫拉菌属、 狡诈球菌属等,T1组差异属为双歧杆菌属、乳酸杆菌属等(图 5B)。
图5 T1与T2分组物种差异分析
/ 总结 /
本研究通过16s rRNA测序, 鉴定了肺腺癌患者不同分组 (N0期与N+期、T1期与T2期、临床分期 (I、II、III期)、吸烟与不吸烟 ) 中肺癌组织的特征微生物 ,并 发现双歧杆菌属的丰度与淋巴结转移和肿瘤进展相关。本研究提示特征微生物可成为一种潜在的肺腺癌诊断标志物。
*本研究使用了迪飞医学mNGS检测技术
参考文献:Chen M, Cui Y, Liu C, Tong X, Wang M, Wu C, Liu Y, Zhao Y, Chen X. Characteristics of the microbiome in lung adenocarcinoma tissue from patients in Kunming city of southwestern China. Environ Sci Pollut Res Int. 2023 Apr;30(17):49992-50001. doi: 10.1007/s11356-023-25528-1. Epub 2023 Feb 14. PMID: 36787077.
钦州民营医院献上旅游惠民文化盛宴
钦州宝顺医院医护志愿者在第12 个“中国旅游日”志愿演出活动中闪亮登场,为广大市民献上一场旅游惠民盛宴。
影像“断案”47年的临床医学“法官”
精准医疗,诊断先行;医学诊断,技术先行。所谓精准医疗,其实包括精准诊断和精准治疗,精准诊断对于精准医疗意义重大,因此精准医疗有赖于高质量、精准的影像诊断。
共同富裕是社会主义的根本原则
从2020年开始,以美国为首的西方国家先是通过大量印钞导致全球范围内的通货膨胀,使以美元和欧元计价的原材料如钢铁、石油、粮食、化工原料的价格出现大幅上涨
共同富裕是社会主义的根本原则
共同富裕是全体人民通过辛勤劳动和相互帮助最终达到丰衣足食的生活水平,也就是消除两极分化和贫穷基础上的普遍富裕,是建设中国特色社会主义理论的重要内容之一。共同富裕是社会主义的本质规定和奋斗目标,也是我国社会主义的根本原则。
新共委努力推进新集体共富示范区建设
新集体共富工作委员会(简称新共委)正在和地方政府探讨合作成立以地级市为单位的新集体共富示范区,成立示范区的目的是在坚持新时代特色社会主义思想前提下,以实现全民共同富裕为指引,坚持发展新型集体经济,带动、落实乡村振兴,依托全国各地的每一个地级区域,申请打造一个新型集体经济共同富裕的国家级示范区,然后全国范围推广、复制,实现全民和全社会共同参与,最终实现共同富裕。
新集体共富工作委员会成立的背景
“共同富裕是社会主义的本质要求,是人民群众的共同期盼。”党的十九届五中全会把促进全体人民共同富裕摆在更加重要的位置,强调“扎实推动共同富裕,不断增强人民群众获得感、幸福感、安全感,促进人的全面发展和社会全面进步”。这为我们在“十四五”时期乃至更长一个时期扎实推动共同富裕指明了方向、提供了动力。
新集体共富工作委员会成立的意义及优势
新共委服务于政府、服务于企业、服务于社会、服务于人民,在现有经济基础上实现会员企业资源共享、信息互通、行业发展、思想共融的重要环节,在政府与企业、社会、人民之间发挥着无可替代的中介作用,是实现政府与社会、企业、人民相互联系的重要桥梁和纽带。